Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl17Q9CPR4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl17Q9CPR4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl17Q9CPR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl17Q9CPR4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms