Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6dQ99N07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms