Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cstf3Q99LI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms