Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp3Q99JB6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxp3Q99JB6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxp3Q99JB6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms