Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trps1Q925H1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trps1Q925H1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trps1Q925H1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trps1Q925H1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms