Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbox1Q924Y0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbox1Q924Y0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbox1Q924Y0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms