Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc6Q924W5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc6Q924W5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc6Q924W5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms