Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf7Q922B6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf7Q922B6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Traf7Q922B6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms