Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx15Q91WE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx15Q91WE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms