Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms