Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cbx7Q8VDS3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx7Q8VDS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx7Q8VDS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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