Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1Q8VDF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Uhrf1Q8VDF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uhrf1Q8VDF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Uhrf1Q8VDF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Uhrf1Q8VDF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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