Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fyco1Q8VDC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fyco1Q8VDC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms