Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nae1Q8VBW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nae1Q8VBW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms