Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmx1Q8VBT0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmx1Q8VBT0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmx1Q8VBT0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmx1Q8VBT0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms