Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mkl1Q8K4J6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Mkl1Q8K4J6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms