Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn4Q8K3Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn4Q8K3Q3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms