Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccm2Q8K2Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccm2Q8K2Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccm2Q8K2Y9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms