Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo18Q8K2I9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo18Q8K2I9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms