Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sde2Q8K1J5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sde2Q8K1J5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sde2Q8K1J5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms