Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgbQ8K0E8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgbQ8K0E8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms