Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nav1Q8CH77 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nav1Q8CH77 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nav1Q8CH77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nav1Q8CH77 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nav1Q8CH77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nav1Q8CH77 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nav1Q8CH77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nav1Q8CH77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nav1Q8CH77 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms