Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hpf1Q8CFE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hpf1Q8CFE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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