Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc17Q8CE13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc17Q8CE13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc17Q8CE13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms