Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb1Q8CBF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb1Q8CBF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb1Q8CBF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms