Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip1Q8CBD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip1Q8CBD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms