Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfrp1Q8C4U3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfrp1Q8C4U3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms