Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub1Q8C0D0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trub1Q8C0D0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trub1Q8C0D0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms