Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm10600Q8BQ57 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm10600Q8BQ57 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms