Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D130040H23RikQ8BII3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
D130040H23RikQ8BII3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms