Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc172Q810N9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc172Q810N9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc172Q810N9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms