Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y73 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y73 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y73 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y73 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y73 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y73 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y73 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y73 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y73 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q80Y73 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y73 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y73 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y73 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y73 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q80Y73 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y73 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y73 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q80Y73 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y73 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q80Y73 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q80Y73 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q80Y73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q80Y73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q80Y73 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y73 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y73 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y73 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y73 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y73 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q80Y73 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q80Y73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q80Y73 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q80Y73 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q80Y73 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y73 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y73 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q80Y73 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q80Y73 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q80Y73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y73 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q80Y73 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y73 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms