Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ8

Mis18bp1, Mis18-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18bp1Q80WQ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis18bp1Q80WQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis18bp1Q80WQ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms