Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms