Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casd1Q7TN73 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casd1Q7TN73 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casd1Q7TN73 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casd1Q7TN73 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms