Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HhipQ7TN16 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HhipQ7TN16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HhipQ7TN16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms