Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpopQ6ZWS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpopQ6ZWS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms