Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spcs3Q6ZWQ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spcs3Q6ZWQ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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