Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M2Q6W9L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M2Q6W9L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M2Q6W9L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms