Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med16Q6PGF3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms