Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfrlQ6PE55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms