Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Gapvd1Q6PAR5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gapvd1Q6PAR5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Gapvd1Q6PAR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms