Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa4Q6P8K8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpa4Q6P8K8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpa4Q6P8K8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms