Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ptpdc1Q6NZK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpdc1Q6NZK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms