Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RragbQ6NTA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RragbQ6NTA4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RragbQ6NTA4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RragbQ6NTA4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms