Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Best3Q6H1V1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Best3Q6H1V1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Best3Q6H1V1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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