Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Carmil1Q6EDY6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Carmil1Q6EDY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Carmil1Q6EDY6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Carmil1Q6EDY6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms