Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Smarca2Q6DIC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Smarca2Q6DIC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Smarca2Q6DIC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms