Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc2Q69ZB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms