Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a3Q64518 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a3Q64518 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a3Q64518 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms